علوم اعصاب 58806 //
سه سال پیش منتشر شده
تعداد بازدید: 146
کد پروژه: 420857
شرح پروژه
#کد_پروژه: 58806
موضوع: پروژه علوم اعصاب //
رمن پروژه ای با کلیتی که در زیر توضیح میدم میخواستم
ژن های درگیر در بیماری اتیسم (BDNF داخلش باشه)
نام های دیگر ژن- شماره دسترسی، جایگاه کروموزومی
توالی ژن BDNF و همچنین توالی پروتئینی مربوط به این ژن
مقایسه توالی پروتئینی BDNF با ۴ گونه دیگر مثل (میمون، موش و...) در clustal omega و alignment به صورت show color و همچنین غیر رنگی
جهش های ژن BDNF رو از clinvar
طراحی پرایمر ریورس و فوروارد برای مطالعه آن جهش ها، و سپس primer- blast انجام شود برای آن و نتایج بلاست آنها و نقایسه توالی هرکدام با دیتابیس سایت
ساختار سه بعدی BDNF در پایمول
و بعد
تاثیر آن جهش مذکور را در ساختار پروتئین از طریق modeling نشون بدین و اطلاعات مربوطه در این بخش شاخص ها، نقشه راماچاندران و... قرار گیرد
پیش بینی پاتولوژیک بودن یا نبودن جهشی که در clinvar بررسی کردیم از طریق polyphen-2
بررسی BDNF در STRING
برای BDNF و ژن های همکارش در مسیر Autism شبکه عملکردی ساخته بشه
و تنظیم بیان ژن شون از طریق miR ها هم بررسی بشه که چه miR هایی در تنظیم بیان BDNF نقش دارن این توضیحات پروژه بنده اس و اینکه قاعدتا اسکرین و توضیحات همه این بخش ها در پاور موجود باشه نرم افزارهاشو اغلب براتون نوشتم علوم اعصاب یک هفته توالی ژن و اینها که از gene bank
مقایسه توالی clustal omega
طراحی پرایمر با primer3 plus
برای bladt هم سرچ کنید سایت بالا میاد
ساختار سه بعدی هم نرم افزارش پایمول هست که باید از pdb فایلش گرفته بشه
برای modeling هم swiss model
پیش بینی پاتولوژیک بودن یا نبودن در polyphen
شبکه عملکردی پروتئین با string
مسیرهای سلولی تا بیماری با kegg
و پیش بینی پیوند دی سولفیدی از اسکرچ (dianna باز نمیشه)
و میکرو rna هم با mirbase و mirwalk و target scan
9873
مهارت ها و تخصص های مورد نیاز
مهلت برای انجام
7روز
وضعیت مناقصه
بسته
درباره کارفرما
عضویت چهار سال پیش
