ادیت پروژه پایانی مطابق موارد درخواستی

---

شرح پروژه

با عرض سلام موارد زیر پیام مشتری برای ادیت کار هست:

Hojat, [Feb 4, 2024 at 20:33]

شیوا من اینو نگاه کردم درست نمیاد رو گوشی ولی در کل ببین کار ما سه مرحله بوده تو محیط کشت ۱- تاثیر باکتری روی قارچ(نوشتی اوکیه اون ولی دیگه نمی دونم از رو دیتاهای ک برات فرستادم نوشتی یا از من کپی کردی اینو چک کن تو فصل سه و چهار ک کلا از من کپی کردی حتی جدولا و نمودار های که دادم ببین هر کس نمونه ش فرق میکنه اسمش تو فقط یه نمونه داشتی) ۲- تاثیر عصاره باکترب روی قارچ(ننوشتی اونو دیتاهاشو برات فرستادم قبلا)۳- اثر قارچ کش پلی اوکسین روی قارچ(اونم ننوشتی کلا جواب نداد این برای همه دلیل اینکه از بچه ها هم نمره کم شد همین بود گرن مهرگان دیگه😂)

Hojat, [Feb 4, 2024 at 20:33]

بعد از اونم ما نمونه هارو دادیم پی سی ار و تعیین توالی ک باز اونو برات فرستادم الان توالی های ک گذاشتی برا منه تو برای خودتو کپی کن همونجا

Hojat, [Feb 10, 2024 at 12:00]

شیوا اینا که الان میفرستم برای منه کلا پاک کن، بعد ببین من اینارو‌تو‌فایل زییب برات فرستادم قبلا، هم توالی باسیلوس ولزنیسیس هم توالی قارچت بوتریس سینرا اینارو با برنامه کروماس باید چک کنی ببینی کجا پیک ها اوکی شده همون ناحیه رو فقط بدی به سایت ncbi بعد بهت میگه کدوم سویه س این (البته چون فقط 16srrna گذاشتیم دقیق نیست ولی اوکیه باز قبول کردن ) ،الان تو کلا دیتا یه باکتری دیگه گذاشتی استرپتومایسس رو‌گذاشتی ، تو عنوانت امده دیگه باسیلسو ولزنیسین، برای عصاره هم ما hplc نذاشتیم نیازی نبوده چون ما هدفمون تفکیک موادی ک‌ باکتری تولید میکنه نبوده

Hojat, [Feb 10, 2024 at 12:02]

درباره درخت فیلوژنیک هم وقتی توالی رو شناسایی کردی با سایت ncbi همون موقع ۱۰۰ تا نتیجه میده ک‌به هم نزدیکن مثلا تا ۷۰ درصد و‌اینا یه ۵ تاشونو تولیسونو کپی کن تو نرم افزار مگا بعد دوباره از همون سایت ncbi یه باکتری ک یه خورده از لحاظ ژنتیکی دورتره رو باز توالیشو بذار مثلا باسلیوس تونجنیسس

Hojat, [Feb 10, 2024 at 12:02]

اینا همه دیتا های منه

Hojat, [Feb 10, 2024 at 12:03]

ببین درخت فیلوژنیت باید اینجوری باشه اونی ک گذاشتی حالا کپی کرده از استرپتومایسس غلطه

Hojat, [Feb 10, 2024 at 12:04]

ببین ۵ تا سویه ک ولزنیسس باشن به علاوه یه سویه ک دور تره مثلا تورنجنسیس که فاصله سویه ها مشخص باشه

Hojat, [Feb 11, 2024 at 21:33]

شیوا همه دیتا های سکانس باکتری و قارچ توی این فایل زیپه خلاصه بگم که بدونی چی کردم، ببین اول نمونه رو دادیم pcr بعد هم فرستادیم ازمایشگاه برای سکانس اونا توالی رو بهمون دادن که یه فایل (فرستادم که داشته باشی تو پوشه س) اون فایل رو اول با نرم افزار کروماس چک کردم که ببینم کجای توالی یا کوئری که بهم داده خوب خوانش شده (مثلا از 20 تا 400) بعد فایلو دادم به سایت ncbi (مشخص کردم براش همون توالی که خوب خوانش شده رو فقط چک کنه)بهم گفت که اسم نمونه ام چیه بعد از اون هم برای کشیدن درخت از بین 100 نتیجه اولی که سایت بهم داده بود دیتا fasta رو گرفتم (ده نمونه حدودا) با نرم افزار مگا اول الاین کردم  بعد گزینه nieghbor-joining tree و بعد هم bootstrap 1000 درخت رو کشیدم

Hojat, [Feb 11, 2024 at 21:33]

این توضیحات بالارو دادم که کلا بدونی اگر پرسیدن سر دفاع چی بگی

Hojat, [Feb 11, 2024 at 21:34]

ولی کلا از پوشه بالا اون چهار تا عکس رو که فرستادم باید بذاری توی پایان نامه

Hojat, [Feb 11, 2024 at 21:39]

کلا توضیحاتی که دادم کلی بود ریزه کاری زیاد داره هرجا سوال داشتی بپرس

این پروژه شامل 1 فایل مهم است، لطفا قبل از ارسال پیشنهاد حتما نسبت به بررسی این فایل اقدام فرمایید.

مهارت ها و تخصص های مورد نیاز

---

---