سفارش پروژه بیوانفورماتیک

---

شرح پروژه

سلام وقتتون بخیر و شادی
ببخشید من مزاحمتون میشم
شما کسی رو در مجموعه تون دارید پروژه بیوانفورماتیک انجام بدن و در این زمینه ماهر باشند؟
من واقعیتش یه دونه زخم پوش فتوترمال حاوی عصاره گیاهی دارم و داده‌های cfu و  جهش دمایی فیلم و داکینگ مولکولی مواد موثره عصاره رو با پروتئین زخم رو هم دارم.
حالا میخوام با استفاده از این داده‌ها یک کد متلب برای شبیه‌سازی با قابلیت تجسم پذیری برای ترمیم زخم عفونی داشته باشم که اثر توامان افزایش دما و عصاره گیاهی داشته باشیم.
با کلی نمودار و ... که چشم داور مقاله رو بگیره.

عنوان پروژه:
شبیه‌سازی و تجسم تأثیر همزمان دما و عصاره گیاهی در ترمیم زخم‌های عفونی با استفاده از داده‌های داکینگ مولکولی و CFUو تحلیل جهش دمایی
شرح پروژه:
هدف این پروژه، توسعه یک نرم‌افزار شبیه‌سازی و تجسم‌سازی است که اثرات توامان افزایش دما و کاربرد عصاره‌های گیاهی بر روند ترمیم زخم‌های عفونی را با استفاده از نتایج داکینگ مولکولی و داده‌های تجربی CFU و جهش دمایی مدل‌سازی می‌کند.
داده‌های ورودی:

فایل‌های داکینگ مولکولی با پسوند .mvdresults
داده‌های CFU (واحدهای تشکیل کلنی) در قالب فایل .csv
داده‌های جهش دمایی فیلم در قالب فایل .csv

خروجی‌های مورد انتظار:

شبیه‌سازی تعاملی از فرایند ترمیم زخم با قابلیت تنظیم پارامترهای مختلف
نمایش بصری و گرافیکی تأثیر متغیرهای دما و غلظت عصاره گیاهی
گزارش‌های تحلیلی و آماری از روند بهبود زخم تحت شرایط مختلف
امکان مقایسه بصری نتایج داده‌های واقعی با نتایج شبیه‌سازی شده


قابلیت‌های فنی مورد نیاز

پارسینگ و استخراج داده‌های داکینگ مولکولی از فایل‌های .mvdresults
پردازش و یکپارچه‌سازی داده‌های CFU و جهش دمایی از فایل‌های .csv
مدل‌سازی ریاضی تعاملات مولکولی مبتنی بر نتایج داکینگ
شبیه‌سازی اثر دما بر فعالیت ضدمیکروبی عصاره‌های گیاهی
ایجاد مدل زمانی از روند ترمیم زخم با پارامترهای متغیر دما و غلظت عصاره
توسعه رابط کاربری برای تنظیم پارامترها و مشاهده نتایج شبیه‌سازی
قابلیت استخراج گزارش‌های آماری و نمودارهای مقایسه‌ای

تلفیق مدل‌های بیومکانیکی: ادغام مدل‌های بیومکانیکی بافت برای شبیه‌سازی واقعی‌تر ترمیم زخم
شبیه‌سازی چند مقیاسی: پیاده‌سازی شبیه‌سازی چند مقیاسی که هم سطح مولکولی و هم سطح بافتی را در نظر بگیرد
الگوریتم‌های پیش‌بینی کننده: استفاده از روش‌های یادگیری ماشین برای پیش‌بینی بهترین ترکیب دما و غلظت عصاره گیاهی برای شرایط مختلف زخم
داشبورد تعاملی: ایجاد یک داشبورد تعاملی با قابلیت‌های زیر:

تنظیم پارامترهای دما و غلظت در زمان واقعی
مشاهده روند تغییرات در طول زمان
مقایسه همزمان چندین سناریوی مختلف
صدور گزارش‌های قابل چاپ


سیستم پایگاه داده: ایجاد یک پایگاه داده برای ذخیره نتایج شبیه‌سازی‌های مختلف و امکان فراخوانی و مقایسه آنها در آینده
بخش تحلیل حساسیت: افزودن بخشی برای تحلیل حساسیت مدل به تغییرات پارامترهای مختلف برای شناسایی عوامل کلیدی در ترمیم زخم
ماژول تشخیص بهینه: طراحی ماژولی که بتواند شرایط بهینه (دما و غلظت عصاره) را برای سریع‌ترین روند ترمیم زخم پیشنهاد دهد

مهارت ها و تخصص های مورد نیاز

---

---