پایتون و پزشکی - 113642
شانزده روز پیش منتشر شده
تعداد بازدید: 157
کد پروژه: 608833
شرح پروژه
سلام وقتتون بخیر
این یک نمونه داده ECG،PET و MRI هست به همراه مقالات مرتبط.
راستش خودم هنوز کامل بر موضوع حاکم نیستم و مواردی که استادم گفتن رو مینویسم:
داده ها برای بیماری سارکئودوز قلبی است.
هدف بهبود تشخیص با استفاده از مدل سازی قلب هست.
گفتن از دو تا نرم افزار Sci-Run و Opencard استفاده میشه
دادههای فیزیولوژیک ECG و MRI رو به Sci-run بدی نواحی فعال قلب رو شناسایی کنه و سپس مقایسه با نتایج PET که بفهمیم کجای قلب مشکل داره
از روی ECG ای که میدیم نواحی فعال یا فیبروز یا هر مشکلی داره رو مقایسه کنیم با نتایج PET
بفهمیم چقدر این روش میتواند جایگزین پت شود.
تا جایی هدایت الکتریکی مربوط به نواحی قلب رو تغییر بدیم بر روی سیگنال ECG که در نهایت فعالیت سیگنال ECG که نشون دهنده قسمت های بیماری هست با نتایج پت تطابق پیدا کنه.
دزواقع انقدر هدایت هارو عوضکنید که به اون نواحی غیرفعال برسید که با پت رسیدید.
ECG داری، نواحی مشکل دارو دراوردی حالا این نواحی با پت نمیخونه انقدر تغییر میدی تا یک حالت دقیق دربیاره (با opencard)
دنبال این هستیم که از ECG و PET یک سری ویژگی های مشابه که در یک دسته هستند دربیاریم
دسته بندی یا خوشه بندی کنیم
مثلا دسته بندی بیماران یا بطن راست و بطن چپ
یا مزمن و حاد
از این ویژگی ها برای خوشه بندی رخداد جدید
در واقع از الگوهای پنهان این ها بتونیم برای تشخیص نارسایی ها استفاده کنیم.
اگر گنگ باشه میتونم وویس های ایشون رو بفرستم
فاز ۱: استخراج و پردازش ECG
کار: خواندن DICOM، استخراج ۱۲ لید، پیدا کردن R-peak و زمان QRS
هدف و خروجی: سیگنال ECG تمیز + زمانبندی دقیق چرخه قلبی برای همگامسازی با MRI و PET
فاز ۲ : تبدیل MRI و سگمنتیشن خودکار قلب
کار: تبدیل DICOM به NIfTI و اجرای TotalSegmentator (HeartChambers)
هدف و خروجی: ماسک سهبعدی دقیق از ۴ حفره قلب + میوکارد
فاز ۳ : تولید مش سهبعدی بهینهشده
کار: الگوریتم Marching Cubes، Smoothing و کاهش وجوه مثلث ها
هدف و خروجی: مشهای simulation-ready از هر ساختار فایل .vtp / .stl))
فاز ۴ : مدلسازی بیومکانیکی
کار: وارد کردن مشها در SCIRun و اختصاص مدل ماده Holzapfel-Ogden + جهت فیبر
هدف و خروجی: مدل مکانیکی کامل قلب (قابلیت محاسبه تنش/کرنش و کسر جهشی)
فاز ۵ : ساخت مدل الکتریکی بیمار-اختصاصی
کار: همترازی PET روی MRI ،تبدیل شدت PET به هدایت الکتریکی (سالم/مرزی/اسکار) و ساخت تانسور هدایت
هدف و خروجی: فایل .elem و .lon با هدایت ناهمگن واقعی بیمار
فاز ۶ :شبیهسازی نهایی
کار: اجرای شبیهسازی الکتریکی در openCARP و مکانیکی در SCIRun
هدف و خروجی: نقشه فعالسازی، pseudo-ECG، نقشه تنش/کرنش و پیشبینی آریتمی/نارسایی
ولیدیشن ۱ – تطابق نواحی فعال ECG با PET
کار: استخراج Activation Time Map از openCARP و مقایسه با نواحی FDG-avid در PET
هدف و خروجی: اثبات اینکه مدل درست تشخیص میده کدام نواحی قلب واقعاً فعال هستند
ولیدیشن ۲ – پیشبینی ECG از مدل (حل معکوس)
کار: تولید ECG ۱۲ لید مصنوعی از مدل در openCARP و مقایسه شکل و زمانبندی با ECG واقعی بیمار
هدف و خروجی: اثبات اینکه مدل الکتریکی دقیقاً همان سیگنالی را تولید میکند که در بدن بیمار ثبت شده
این پروژه شامل 2 فایل مهم است، لطفا قبل از ارسال پیشنهاد حتما نسبت به بررسی این فایل اقدام فرمایید.
مهارت ها و تخصص های مورد نیاز
مهلت برای انجام
2روز
وضعیت مناقصه
بسته
درباره کارفرما
عضویت سه سال پیش
