جدا کردن بخشی از یک جدول توسط برنامه R

شرح پروژه

با عرض سلام 

توسط کد زیر جدولی از زوایا ایجاد شده 

می خواهم بخشی از این جدول را طبق لیست  (یعنی چند ردیف مشخص شده در لیست) جدا کنم.

لیست بخشهایی که می خواهم جدا شود در فایل اکسل پیوست شده است.

کد نوشته شده برای جدا کردن زوایا

library(bio3d)

#fetches the pdb file from the protein data bank and saves to dataframe 'pb'

pb <- read.pdb("insert PDB ID") 

#trim to protein only

pb.prot <- trim.pdb(pb, "protein")

#calculates the torsion angles of the protein and save to dataframe 'tor'

tor <- torsion.pdb(pb.prot)

#to get the number of rows and columns of 'tor'

dim(tor$tbl)

#identify each row by their chain, residue ID and residue Number obtained from your PDB entry

res_label <- paste(pb.prot$atom$chain[pb.prot$calpha], pb.prot$atom$resid[pb.prot$calpha], pb.prot$atom$resno[pb.prot$calpha], sep="-")

rownames(tor$tbl) <- res_label

#creates a table of the torsion angle

torsion <- tor$tbl 

#For example, to look at the angles for VAL, residue 223 from chain A

tor$tbl["A-GLY-65",]

#writes out the table to a file

     phi                      psi            chi1       chi2      chi3     chi4       chi5              

-63.07696       -44.08316        NA        NA        NA        NA        NA

How do I change this code if I want to separate the angles of several rows

For example, the angles of rows

A-PHE-123

 A-GLY-124 

A-ALA-125 

A-ASP-126 

A-ALA-127 

A-GLN-128  

این پروژه شامل 1 فایل مهم است، لطفا قبل از ارسال پیشنهاد حتما نسبت به بررسی این فایل اقدام فرمایید.

مهارت ها و تخصص های مورد نیاز

درباره کارفرما

کاربر185046

عضویت پنج سال پیش

3 پروژه ثبت شده ،

0 پروژه در حال انجام ،

0 پروژه آماده دریافت پیشنهاد ،

نرخ پذیرش پیشنهاد 67%