50943 پایتون یا R
سه سال پیش منتشر شده
تعداد بازدید: 157
کد پروژه: 384078
شرح پروژه
ورودی: فایل fasta حاوی contigهای اسمبلی شده با حداقل طول 200bp (حدود 5 میلیون contigs) خروجی: نوع آنزیم کد شده توسط هر کانتیک به همراه توالی آن به فرمت fasta ۱)در ابتدا فایل حاوی کانتیگ ها به ۶ فریم ترجمه شود. (بصورت دستی و با کد پایتون یا R انجام شود چون کدها هم برای ارائه لازم است) ۲) سپس ۶فریم بدست امده(توالی پروتئینی) با دیتابیس non-redundant protein NCBI بصورت اتوماتیک(بااستفاده از API به سرور NCBI( هم ردیف شوند. براساس بالاترین score bit و بیشترین coverage ،صحیح ترین توالی پروتئینی بین ۶ فریم ترجمه شده، انتخاب شود. (برای تعیین پروتین اصلی حتما باید یه کد پایتون یا R نوشته شود ) خروجی باید فایل fasta باشد که در توضیح هر توالی منتخب، نام کانتیگ و آنزیم مربوطه ذکر شود
با پایتون یا R
زمان کمی دارم دو روز
این پروژه شامل 1 فایل مهم است، لطفا قبل از ارسال پیشنهاد حتما نسبت به بررسی این فایل اقدام فرمایید.
مهارت ها و تخصص های مورد نیاز
مهلت برای انجام
2روز
وضعیت مناقصه
بسته
درباره کارفرما
عضویت چهار سال پیش
